طی ارزشیابی اخیر کارگروه‌های اخلاق در وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، کارگروه اخلاق دانشگاه شاهد توانسته است با ۴۰٪ پیشرفت نسبت به عملکرد سال گذشته خود، در تمامی بندهای ارزیابی نمره کامل را کسب نماید. کارگروه اخلاق در پژوهش‌های زیستی دانشگاه شاهد وظیفه بررسی علمی و اخلاقی مطالعات انسانی (اعم از مطالعات کارآزمایی بالینی و مطالعات بدون مداخله) و حیوانی و تخصیص کد اخلاق به آنها را دارد. علاوه بر موراد فوق، کلیه پژوهشهای گروههای وزارت بهداشت، گروه های روانشناسی و فیزیولوژی ورزشی شامل تمام پایان نامه ها و طرحها، به این کارگروه ارجاع داده می‌شوند. نظارت و ارزیابی روند انجام پژوهش ها و رعایت اخلاق در حین پژوهش از دیگر وظایف اعضای متخصص کارگروه می باشد. همچنین این کارگروه مرجع دریافت شکایات و رسیدگی به تخلفات پژوهشی و برگزاری کارگاه های آموزشی در حوزه اخلاق نیز می باشد. تاکنون بیش از ۱۱۰۰ پژوهش در این کارگروه بررسی شده است و با توجه به عملکرد مثبت کارگروه و حجم فعالیت آن، اخیرا مجوز راه‌اندازی دو کمیته اخلاق در پژوهش های زیست پزشکی و اخلاق در کار با حیوانات آزمایشگاهی از طرف کمیته ملی اخلاق صادر گردیده است تا ضمن بررسی تخصصی پژوهش‌ها، امکان نظارت بیشتر نیز فراهم گردد.